המועצה תממן, בכל שנה אקדמית, שתי עבודות גמר בתחומי רפת החלב ובריאות הציבור, ועוד שתי עבודות גמר בתחום רווחת בע"ח – בקר וצאן. סך המימון הוא 20.000 ₪ (5,000 ₪ לכל עבודת גמר). כן תשקיע המועצה סך של 20,000 ₪ בכל שנה במימון ארבע מלגות הצטיינות לסטודנטים (5,000 ₪ למלגה) בתחומי מעלי גירה ובריאות הציבור. המועצה תהיה רשאית לפרסם את העבודות, שיצורף להן קרדיט למועצת החלב, באתר המועצה באינטרנט, או בכל דרך פרסום אחרת.
את המלגות והפרסים יעניק מנכ"ל מועצת החלב, או בא כוחו, במהלך טקס פתיחת כנס מדעי הבקר שמתקיים בירושלים מדי שנה.